Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFSF9P41273 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFSF9P41273 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms