Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC26A3P40879 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC26A3P40879 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms