Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARL4AP40617 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARL4AP40617 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARL4AP40617 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARL4AP40617 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARL4AP40617 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARL4AP40617 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARL4AP40617 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARL4AP40617 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARL4AP40617 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ARL4AP40617 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARL4AP40617 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARL4AP40617 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARL4AP40617 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARL4AP40617 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARL4AP40617 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARL4AP40617 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARL4AP40617 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ARL4AP40617 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARL4AP40617 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARL4AP40617 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARL4AP40617 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARL4AP40617 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ARL4AP40617 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARL4AP40617 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ARL4AP40617 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARL4AP40617 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARL4AP40617 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARL4AP40617 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARL4AP40617 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARL4AP40617 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARL4AP40617 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARL4AP40617 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARL4AP40617 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARL4AP40617 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARL4AP40617 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARL4AP40617 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARL4AP40617 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARL4AP40617 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARL4AP40617 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARL4AP40617 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARL4AP40617 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARL4AP40617 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARL4AP40617 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARL4AP40617 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms