Protein–RNA interactions for Protein: P40429

RPL13A, 60S ribosomal protein L13a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP40429 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL13AP40429 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL13AP40429 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms