Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PBX1P40424 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PBX1P40424 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PBX1P40424 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PBX1P40424 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PBX1P40424 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PBX1P40424 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PBX1P40424 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PBX1P40424 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PBX1P40424 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PBX1P40424 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PBX1P40424 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PBX1P40424 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PBX1P40424 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PBX1P40424 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PBX1P40424 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PBX1P40424 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PBX1P40424 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PBX1P40424 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PBX1P40424 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PBX1P40424 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PBX1P40424 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PBX1P40424 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PBX1P40424 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PBX1P40424 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PBX1P40424 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PBX1P40424 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PBX1P40424 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PBX1P40424 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PBX1P40424 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PBX1P40424 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PBX1P40424 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PBX1P40424 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PBX1P40424 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PBX1P40424 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PBX1P40424 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PBX1P40424 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PBX1P40424 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PBX1P40424 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PBX1P40424 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PBX1P40424 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PBX1P40424 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PBX1P40424 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PBX1P40424 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PBX1P40424 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PBX1P40424 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PBX1P40424 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PBX1P40424 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PBX1P40424 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PBX1P40424 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PBX1P40424 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PBX1P40424 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PBX1P40424 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PBX1P40424 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PBX1P40424 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PBX1P40424 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PBX1P40424 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PBX1P40424 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PBX1P40424 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PBX1P40424 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PBX1P40424 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PBX1P40424 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PBX1P40424 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PBX1P40424 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PBX1P40424 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PBX1P40424 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PBX1P40424 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PBX1P40424 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PBX1P40424 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBX1P40424 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBX1P40424 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PBX1P40424 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBX1P40424 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PBX1P40424 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBX1P40424 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBX1P40424 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PBX1P40424 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PBX1P40424 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PBX1P40424 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PBX1P40424 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PBX1P40424 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PBX1P40424 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PBX1P40424 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PBX1P40424 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBX1P40424 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBX1P40424 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBX1P40424 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBX1P40424 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBX1P40424 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBX1P40424 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PBX1P40424 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PBX1P40424 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX1P40424 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX1P40424 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX1P40424 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX1P40424 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX1P40424 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX1P40424 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX1P40424 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PBX1P40424 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms