Protein–RNA interactions for Protein: P40105

YRF1-2, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-2P40105 YER145C-AYER145C-A 438 nt6.04□□□□□ -1.44
YRF1-2P40105 GMH1YKR030W 822 nt6.04□□□□□ -1.44
YRF1-2P40105 MAL13YGR288W 1422 nt6.03□□□□□ -1.44
YRF1-2P40105 VTC2YFL004W 2487 nt6.03□□□□□ -1.44
YRF1-2P40105 YCR023CYCR023C 1836 nt6.03□□□□□ -1.44
YRF1-2P40105 ROT2YBR229C 2865 nt6.03□□□□□ -1.44
YRF1-2P40105 YGR153WYGR153W 654 nt6.03□□□□□ -1.44
YRF1-2P40105 YNG1YOR064C 660 nt6.03□□□□□ -1.44
YRF1-2P40105 MET31YPL038W 534 nt6.03□□□□□ -1.44
YRF1-2P40105 YPL278CYPL278C 303 nt6.03□□□□□ -1.44
YRF1-2P40105 TYW3YGL050W 822 nt6.02□□□□□ -1.45
YRF1-2P40105 RRP40YOL142W 723 nt6.02□□□□□ -1.45
YRF1-2P40105 snR10snR10 245 nt6.02□□□□□ -1.45
YRF1-2P40105 FKH2YNL068C 2589 nt6.01□□□□□ -1.45
YRF1-2P40105 ARB1YER036C 1833 nt6.01□□□□□ -1.45
YRF1-2P40105 RXT3YDL076C 885 nt6.01□□□□□ -1.45
YRF1-2P40105 GTO1YGR154C 1071 nt6.01□□□□□ -1.45
YRF1-2P40105 NKP2YLR315W 462 nt6.01□□□□□ -1.45
YRF1-2P40105 PUS1YPL212C 1635 nt6□□□□□ -1.45
YRF1-2P40105 RSC6YCR052W 1452 nt6□□□□□ -1.45
YRF1-2P40105 ZPS1YOL154W 750 nt6□□□□□ -1.45
YRF1-2P40105 BRE2YLR015W 1518 nt5.99□□□□□ -1.45
YRF1-2P40105 VHT1YGR065C 1782 nt5.99□□□□□ -1.45
YRF1-2P40105 APC4YDR118W 1959 nt5.99□□□□□ -1.45
YRF1-2P40105 YMR102CYMR102C 2505 nt5.98□□□□□ -1.45
YRF1-2P40105 TUB3YML124C 1338 nt5.98□□□□□ -1.45
YRF1-2P40105 RAD30YDR419W 1899 nt5.98□□□□□ -1.45
YRF1-2P40105 YCR085WYCR085W 354 nt5.98□□□□□ -1.45
YRF1-2P40105 CAF4YKR036C 1932 nt5.98□□□□□ -1.45
YRF1-2P40105 ARO80YDR421W 2853 nt5.98□□□□□ -1.45
YRF1-2P40105 VID27YNL212W 2349 nt5.97□□□□□ -1.45
YRF1-2P40105 MAS1YLR163C 1389 nt5.97□□□□□ -1.45
YRF1-2P40105 ASA1YPR085C 1332 nt5.97□□□□□ -1.45
YRF1-2P40105 RTC5YOR118W 1704 nt5.97□□□□□ -1.45
YRF1-2P40105 YMR196WYMR196W 3267 nt5.97□□□□□ -1.45
YRF1-2P40105 FRA2YGL220W 363 nt5.97□□□□□ -1.45
YRF1-2P40105 UBI4YLL039C 1146 nt5.97□□□□□ -1.45
YRF1-2P40105 RRN9YMR270C 1098 nt5.97□□□□□ -1.45
YRF1-2P40105 LYP1YNL268W 1836 nt5.96□□□□□ -1.46
YRF1-2P40105 ALG6YOR002W 1635 nt5.96□□□□□ -1.46
YRF1-2P40105 TRX2YGR209C 315 nt5.96□□□□□ -1.46
YRF1-2P40105 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt5.96□□□□□ -1.46
YRF1-2P40105 CTR3YLR411W 726 nt5.96□□□□□ -1.46
YRF1-2P40105 ATH1YPR026W 3636 nt5.96□□□□□ -1.46
YRF1-2P40105 MKK2YPL140C 1521 nt5.96□□□□□ -1.46
YRF1-2P40105 OXP1YKL215C 3861 nt5.95□□□□□ -1.46
YRF1-2P40105 ISY1YJR050W 708 nt5.95□□□□□ -1.46
YRF1-2P40105 PDR18YNR070W 4002 nt5.95□□□□□ -1.46
YRF1-2P40105 NMD5YJR132W 3147 nt5.95□□□□□ -1.46
YRF1-2P40105 BIT2YBR270C 1638 nt5.95□□□□□ -1.46
YRF1-2P40105 CPR1YDR155C 489 nt5.94□□□□□ -1.46
YRF1-2P40105 MID2YLR332W 1131 nt5.94□□□□□ -1.46
YRF1-2P40105 TAF11YML015C 1041 nt5.94□□□□□ -1.46
YRF1-2P40105 MTF1YMR228W 1026 nt5.94□□□□□ -1.46
YRF1-2P40105 UTP11YKL099C 753 nt5.94□□□□□ -1.46
YRF1-2P40105 CBF5YLR175W 1452 nt5.93□□□□□ -1.46
YRF1-2P40105 RGT1YKL038W 3513 nt5.93□□□□□ -1.46
YRF1-2P40105 UBX7YBR273C 1311 nt5.93□□□□□ -1.46
YRF1-2P40105 GSY1YFR015C 2127 nt5.92□□□□□ -1.46
YRF1-2P40105 GAD1YMR250W 1758 nt5.92□□□□□ -1.46
YRF1-2P40105 SUP35YDR172W 2058 nt5.92□□□□□ -1.46
YRF1-2P40105 GCN20YFR009W 2259 nt5.92□□□□□ -1.46
YRF1-2P40105 FAT3YKL187C 2253 nt5.92□□□□□ -1.46
YRF1-2P40105 CBK1YNL161W 2271 nt5.92□□□□□ -1.46
YRF1-2P40105 KAR2YJL034W 2049 nt5.91□□□□□ -1.46
YRF1-2P40105 SNA2YDR525W-A 240 nt5.91□□□□□ -1.46
YRF1-2P40105 HSP150YJL159W 1242 nt5.91□□□□□ -1.46
YRF1-2P40105 SFT2YBL102W 648 nt5.91□□□□□ -1.46
YRF1-2P40105 TRS33YOR115C 807 nt5.91□□□□□ -1.46
YRF1-2P40105 RER1YCL001W 567 nt5.91□□□□□ -1.46
YRF1-2P40105 ASN2YGR124W 1719 nt5.9□□□□□ -1.46
YRF1-2P40105 GDH2YDL215C 3279 nt5.9□□□□□ -1.46
YRF1-2P40105 MHF2YDL160C-A 243 nt5.9□□□□□ -1.47
YRF1-2P40105 YEL077CYEL077C 3834 nt5.9□□□□□ -1.47
YRF1-2P40105 SOL1YNR034W 966 nt5.89□□□□□ -1.47
YRF1-2P40105 PUT1YLR142W 1431 nt5.89□□□□□ -1.47
YRF1-2P40105 DBP9YLR276C 1785 nt5.89□□□□□ -1.47
YRF1-2P40105 ABZ1YNR033W 2364 nt5.89□□□□□ -1.47
YRF1-2P40105 PHM7YOL084W 2976 nt5.89□□□□□ -1.47
YRF1-2P40105 YDL032WYDL032W 312 nt5.88□□□□□ -1.47
YRF1-2P40105 API2YDR525W 330 nt5.88□□□□□ -1.47
YRF1-2P40105 CYC8YBR112C 2901 nt5.88□□□□□ -1.47
YRF1-2P40105 PHO87YCR037C 2772 nt5.88□□□□□ -1.47
YRF1-2P40105 DCD1YHR144C 939 nt5.88□□□□□ -1.47
YRF1-2P40105 SNF8YPL002C 702 nt5.88□□□□□ -1.47
YRF1-2P40105 MNN2YBR015C 1794 nt5.87□□□□□ -1.47
YRF1-2P40105 YJL193WYJL193W 1209 nt5.87□□□□□ -1.47
YRF1-2P40105 PDX3YBR035C 687 nt5.87□□□□□ -1.47
YRF1-2P40105 MCM2YBL023C 2607 nt5.87□□□□□ -1.47
YRF1-2P40105 YMD8YML038C 1329 nt5.87□□□□□ -1.47
YRF1-2P40105 AIM7YDR063W 450 nt5.86□□□□□ -1.47
YRF1-2P40105 YGR127WYGR127W 939 nt5.85□□□□□ -1.47
YRF1-2P40105 QCR2YPR191W 1107 nt5.85□□□□□ -1.47
YRF1-2P40105 KGD1YIL125W 3045 nt5.85□□□□□ -1.47
YRF1-2P40105 MRS2YOR334W 1413 nt5.85□□□□□ -1.47
YRF1-2P40105 YOS9YDR057W 1629 nt5.85□□□□□ -1.47
YRF1-2P40105 RPS4BYHR203C 786 nt5.85□□□□□ -1.47
YRF1-2P40105 RPS4AYJR145C 786 nt5.85□□□□□ -1.47
YRF1-2P40105 YJL215CYJL215C 360 nt5.84□□□□□ -1.47
YRF1-2P40105 IMD3YLR432W 1572 nt5.84□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 72.4 ms