Protein–RNA interactions for Protein: P39748

FEN1, Flap endonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FEN1P39748 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FEN1P39748 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FEN1P39748 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FEN1P39748 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FEN1P39748 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FEN1P39748 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FEN1P39748 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FEN1P39748 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FEN1P39748 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FEN1P39748 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FEN1P39748 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FEN1P39748 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FEN1P39748 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FEN1P39748 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FEN1P39748 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FEN1P39748 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FEN1P39748 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FEN1P39748 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FEN1P39748 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FEN1P39748 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FEN1P39748 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FEN1P39748 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FEN1P39748 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FEN1P39748 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FEN1P39748 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FEN1P39748 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FEN1P39748 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FEN1P39748 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FEN1P39748 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FEN1P39748 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FEN1P39748 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FEN1P39748 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FEN1P39748 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FEN1P39748 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FEN1P39748 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FEN1P39748 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FEN1P39748 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FEN1P39748 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FEN1P39748 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FEN1P39748 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FEN1P39748 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FEN1P39748 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FEN1P39748 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FEN1P39748 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FEN1P39748 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FEN1P39748 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FEN1P39748 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FEN1P39748 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FEN1P39748 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FEN1P39748 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FEN1P39748 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FEN1P39748 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FEN1P39748 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FEN1P39748 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FEN1P39748 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FEN1P39748 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FEN1P39748 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FEN1P39748 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FEN1P39748 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FEN1P39748 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FEN1P39748 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FEN1P39748 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FEN1P39748 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FEN1P39748 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FEN1P39748 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FEN1P39748 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FEN1P39748 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FEN1P39748 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FEN1P39748 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FEN1P39748 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FEN1P39748 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FEN1P39748 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FEN1P39748 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FEN1P39748 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FEN1P39748 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FEN1P39748 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FEN1P39748 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FEN1P39748 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FEN1P39748 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FEN1P39748 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FEN1P39748 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FEN1P39748 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FEN1P39748 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FEN1P39748 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FEN1P39748 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FEN1P39748 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FEN1P39748 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FEN1P39748 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FEN1P39748 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FEN1P39748 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FEN1P39748 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FEN1P39748 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FEN1P39748 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FEN1P39748 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FEN1P39748 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FEN1P39748 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FEN1P39748 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FEN1P39748 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FEN1P39748 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FEN1P39748 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms