Protein–RNA interactions for Protein: P39023

RPL3, 60S ribosomal protein L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3P39023 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL3P39023 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL3P39023 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL3P39023 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL3P39023 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL3P39023 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL3P39023 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL3P39023 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL3P39023 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL3P39023 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL3P39023 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL3P39023 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL3P39023 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL3P39023 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL3P39023 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL3P39023 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL3P39023 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL3P39023 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL3P39023 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL3P39023 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL3P39023 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL3P39023 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL3P39023 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL3P39023 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL3P39023 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL3P39023 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL3P39023 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL3P39023 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL3P39023 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL3P39023 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL3P39023 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL3P39023 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL3P39023 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL3P39023 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL3P39023 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL3P39023 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL3P39023 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL3P39023 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL3P39023 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL3P39023 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL3P39023 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL3P39023 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL3P39023 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL3P39023 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL3P39023 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL3P39023 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL3P39023 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL3P39023 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL3P39023 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL3P39023 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL3P39023 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL3P39023 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL3P39023 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL3P39023 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL3P39023 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL3P39023 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL3P39023 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL3P39023 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL3P39023 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL3P39023 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL3P39023 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL3P39023 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL3P39023 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL3P39023 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL3P39023 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL3P39023 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL3P39023 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL3P39023 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL3P39023 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL3P39023 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL3P39023 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL3P39023 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL3P39023 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL3P39023 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RPL3P39023 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RPL3P39023 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RPL3P39023 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL3P39023 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL3P39023 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL3P39023 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL3P39023 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL3P39023 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL3P39023 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL3P39023 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL3P39023 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL3P39023 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL3P39023 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL3P39023 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL3P39023 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL3P39023 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL3P39023 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL3P39023 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL3P39023 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL3P39023 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL3P39023 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL3P39023 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL3P39023 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL3P39023 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL3P39023 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL3P39023 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms