Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ZEB1P37275 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ZEB1P37275 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ZEB1P37275 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ZEB1P37275 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ZEB1P37275 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ZEB1P37275 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ZEB1P37275 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ZEB1P37275 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
ZEB1P37275 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ZEB1P37275 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ZEB1P37275 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ZEB1P37275 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ZEB1P37275 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ZEB1P37275 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ZEB1P37275 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ZEB1P37275 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ZEB1P37275 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ZEB1P37275 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
ZEB1P37275 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
ZEB1P37275 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ZEB1P37275 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ZEB1P37275 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms