Protein–RNA interactions for Protein: P36026

UBP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, yeastyeast

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBP11P36026 CKB2YOR039W 777 nt5.53□□□□□ -1.52
UBP11P36026 YBR016WYBR016W 387 nt5.53□□□□□ -1.52
UBP11P36026 FEX1YOR390W 1128 nt5.53□□□□□ -1.52
UBP11P36026 FEX2YPL279C 1128 nt5.53□□□□□ -1.52
UBP11P36026 PRR1YKL116C 1557 nt5.53□□□□□ -1.52
UBP11P36026 RIM101YHL027W 1878 nt5.53□□□□□ -1.52
UBP11P36026 DRN1YGR093W 1524 nt5.53□□□□□ -1.52
UBP11P36026 TUL1YKL034W 2277 nt5.53□□□□□ -1.52
UBP11P36026 HXT5YHR096C 1779 nt5.52□□□□□ -1.53
UBP11P36026 RFA1YAR007C 1866 nt5.52□□□□□ -1.53
UBP11P36026 FRE7YOL152W 1863 nt5.52□□□□□ -1.53
UBP11P36026 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt5.52□□□□□ -1.53
UBP11P36026 ARO2YGL148W 1131 nt5.52□□□□□ -1.53
UBP11P36026 PDE1YGL248W 1110 nt5.52□□□□□ -1.53
UBP11P36026 PUS6YGR169C 1215 nt5.52□□□□□ -1.53
UBP11P36026 YKL107WYKL107W 930 nt5.52□□□□□ -1.53
UBP11P36026 PEX22YAL055W 543 nt5.52□□□□□ -1.53
UBP11P36026 POR1YNL055C 852 nt5.52□□□□□ -1.53
UBP11P36026 MGR2YPL098C 342 nt5.52□□□□□ -1.53
UBP11P36026 RGT1YKL038W 3513 nt5.52□□□□□ -1.53
UBP11P36026 YDR132CYDR132C 1488 nt5.51□□□□□ -1.53
UBP11P36026 PHM8YER037W 966 nt5.51□□□□□ -1.53
UBP11P36026 GTO1YGR154C 1071 nt5.51□□□□□ -1.53
UBP11P36026 NSG1YHR133C 876 nt5.51□□□□□ -1.53
UBP11P36026 MIM2YLR099W-A 264 nt5.51□□□□□ -1.53
UBP11P36026 NRM1YNR009W 750 nt5.51□□□□□ -1.53
UBP11P36026 RPL3YOR063W 1164 nt5.51□□□□□ -1.53
UBP11P36026 SER33YIL074C 1410 nt5.5□□□□□ -1.53
UBP11P36026 YDR053WYDR053W 396 nt5.5□□□□□ -1.53
UBP11P36026 RPL12AYEL054C 498 nt5.5□□□□□ -1.53
UBP11P36026 YJL193WYJL193W 1209 nt5.5□□□□□ -1.53
UBP11P36026 OSW5YMR148W 447 nt5.5□□□□□ -1.53
UBP11P36026 YOL035CYOL035C 303 nt5.5□□□□□ -1.53
UBP11P36026 LCB2YDR062W 1686 nt5.5□□□□□ -1.53
UBP11P36026 UBX2YML013W 1755 nt5.5□□□□□ -1.53
UBP11P36026 PCL6YER059W 1263 nt5.49□□□□□ -1.53
UBP11P36026 YNG2YHR090C 849 nt5.49□□□□□ -1.53
UBP11P36026 BUD14YAR014C 2130 nt5.49□□□□□ -1.53
UBP11P36026 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt5.49□□□□□ -1.53
UBP11P36026 TRP3YKL211C 1455 nt5.49□□□□□ -1.53
UBP11P36026 VTC2YFL004W 2487 nt5.49□□□□□ -1.53
UBP11P36026 PDI1YCL043C 1569 nt5.48□□□□□ -1.53
UBP11P36026 SLD2YKL108W 1362 nt5.48□□□□□ -1.53
UBP11P36026 MRPL25YGR076C 474 nt5.48□□□□□ -1.53
UBP11P36026 VPS29YHR012W 849 nt5.48□□□□□ -1.53
UBP11P36026 ISY1YJR050W 708 nt5.48□□□□□ -1.53
UBP11P36026 MTW1YAL034W-A 870 nt5.48□□□□□ -1.53
UBP11P36026 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt5.48□□□□□ -1.53
UBP11P36026 MID2YLR332W 1131 nt5.48□□□□□ -1.53
UBP11P36026 MAC1YMR021C 1254 nt5.48□□□□□ -1.53
UBP11P36026 SCW10YMR305C 1170 nt5.48□□□□□ -1.53
UBP11P36026 DAK1YML070W 1755 nt5.47□□□□□ -1.53
UBP11P36026 CTS1YLR286C 1689 nt5.47□□□□□ -1.53
UBP11P36026 VCX1YDL128W 1236 nt5.47□□□□□ -1.53
UBP11P36026 FUN19YAL034C 1242 nt5.47□□□□□ -1.53
UBP11P36026 NAT5YOR253W 531 nt5.47□□□□□ -1.53
UBP11P36026 RRN3YKL125W 1884 nt5.47□□□□□ -1.53
UBP11P36026 MUM3YOR298W 1440 nt5.47□□□□□ -1.53
UBP11P36026 ZUO1YGR285C 1302 nt5.47□□□□□ -1.53
UBP11P36026 HXT4YHR092C 1731 nt5.46□□□□□ -1.54
UBP11P36026 VHS1YDR247W 1386 nt5.46□□□□□ -1.54
UBP11P36026 YJL107CYJL107C 1164 nt5.46□□□□□ -1.54
UBP11P36026 PHO86YJL117W 936 nt5.46□□□□□ -1.54
UBP11P36026 YKR041WYKR041W 753 nt5.46□□□□□ -1.54
UBP11P36026 snR32snR32 188 nt5.46□□□□□ -1.54
UBP11P36026 FUI1YBL042C 1920 nt5.46□□□□□ -1.54
UBP11P36026 MLF3YNL074C 1359 nt5.45□□□□□ -1.54
UBP11P36026 APE1YKL103C 1545 nt5.45□□□□□ -1.54
UBP11P36026 NGL2YMR285C 1548 nt5.45□□□□□ -1.54
UBP11P36026 YER147C-AYER147C-A 411 nt5.45□□□□□ -1.54
UBP11P36026 ISU2YOR226C 471 nt5.45□□□□□ -1.54
UBP11P36026 DSE3YOR264W 1293 nt5.45□□□□□ -1.54
UBP11P36026 SKI6YGR195W 741 nt5.44□□□□□ -1.54
UBP11P36026 SPL2YHR136C 447 nt5.44□□□□□ -1.54
UBP11P36026 PRS1YKL181W 1284 nt5.44□□□□□ -1.54
UBP11P36026 YML057C-AYML057C-A 390 nt5.44□□□□□ -1.54
UBP11P36026 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt5.44□□□□□ -1.54
UBP11P36026 CUE5YOR042W 1236 nt5.44□□□□□ -1.54
UBP11P36026 MRE11YMR224C 2079 nt5.44□□□□□ -1.54
UBP11P36026 PDC1YLR044C 1692 nt5.43□□□□□ -1.54
UBP11P36026 FHL1YPR104C 2811 nt5.43□□□□□ -1.54
UBP11P36026 LAP2YNL045W 2016 nt5.43□□□□□ -1.54
UBP11P36026 NGR1YBR212W 2019 nt5.43□□□□□ -1.54
UBP11P36026 ACS2YLR153C 2052 nt5.43□□□□□ -1.54
UBP11P36026 MNN2YBR015C 1794 nt5.43□□□□□ -1.54
UBP11P36026 IWR1YDL115C 1062 nt5.43□□□□□ -1.54
UBP11P36026 CAB4YGR277C 918 nt5.43□□□□□ -1.54
UBP11P36026 SPO12YHR152W 522 nt5.43□□□□□ -1.54
UBP11P36026 TOM40YMR203W 1164 nt5.43□□□□□ -1.54
UBP11P36026 UBA3YPR066W 900 nt5.43□□□□□ -1.54
UBP11P36026 ATR1YML116W 1629 nt5.43□□□□□ -1.54
UBP11P36026 YAP1802YGR241C 1707 nt5.43□□□□□ -1.54
UBP11P36026 PWP1YLR196W 1731 nt5.43□□□□□ -1.54
UBP11P36026 NTH2YBR001C 2343 nt5.42□□□□□ -1.54
UBP11P36026 XPT1YJR133W 630 nt5.42□□□□□ -1.54
UBP11P36026 GAT3YLR013W 426 nt5.42□□□□□ -1.54
UBP11P36026 PRT1YOR361C 2292 nt5.42□□□□□ -1.54
UBP11P36026 AIM10YER087W 1731 nt5.42□□□□□ -1.54
UBP11P36026 URA3YEL021W 804 nt5.41□□□□□ -1.54
UBP11P36026 AAD6YFL056C 639 nt5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.4 ms