Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYH11P35749 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYH11P35749 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYH11P35749 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYH11P35749 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYH11P35749 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYH11P35749 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYH11P35749 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYH11P35749 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYH11P35749 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYH11P35749 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYH11P35749 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYH11P35749 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYH11P35749 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYH11P35749 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MYH11P35749 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MYH11P35749 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYH11P35749 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYH11P35749 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYH11P35749 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYH11P35749 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYH11P35749 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYH11P35749 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYH11P35749 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MYH11P35749 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYH11P35749 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYH11P35749 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYH11P35749 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYH11P35749 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYH11P35749 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYH11P35749 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MYH11P35749 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYH11P35749 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MYH11P35749 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MYH11P35749 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MYH11P35749 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MYH11P35749 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYH11P35749 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYH11P35749 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYH11P35749 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYH11P35749 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYH11P35749 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYH11P35749 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYH11P35749 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYH11P35749 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYH11P35749 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYH11P35749 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYH11P35749 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYH11P35749 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MYH11P35749 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYH11P35749 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYH11P35749 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYH11P35749 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYH11P35749 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MYH11P35749 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYH11P35749 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYH11P35749 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYH11P35749 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYH11P35749 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYH11P35749 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYH11P35749 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYH11P35749 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYH11P35749 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYH11P35749 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYH11P35749 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYH11P35749 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYH11P35749 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYH11P35749 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYH11P35749 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYH11P35749 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYH11P35749 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYH11P35749 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYH11P35749 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYH11P35749 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MYH11P35749 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYH11P35749 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYH11P35749 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYH11P35749 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYH11P35749 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYH11P35749 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYH11P35749 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYH11P35749 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYH11P35749 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYH11P35749 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYH11P35749 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYH11P35749 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYH11P35749 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYH11P35749 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MYH11P35749 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MYH11P35749 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MYH11P35749 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MYH11P35749 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MYH11P35749 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYH11P35749 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYH11P35749 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYH11P35749 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYH11P35749 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYH11P35749 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYH11P35749 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYH11P35749 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms