Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX11P35716 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX11P35716 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX11P35716 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX11P35716 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX11P35716 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX11P35716 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX11P35716 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX11P35716 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX11P35716 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX11P35716 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX11P35716 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX11P35716 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX11P35716 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX11P35716 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX11P35716 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX11P35716 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX11P35716 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX11P35716 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX11P35716 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX11P35716 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX11P35716 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX11P35716 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX11P35716 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX11P35716 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX11P35716 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX11P35716 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX11P35716 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX11P35716 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX11P35716 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX11P35716 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX11P35716 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX11P35716 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX11P35716 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX11P35716 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX11P35716 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX11P35716 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX11P35716 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX11P35716 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX11P35716 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX11P35716 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX11P35716 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX11P35716 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX11P35716 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX11P35716 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX11P35716 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX11P35716 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX11P35716 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX11P35716 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX11P35716 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX11P35716 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX11P35716 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX11P35716 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX11P35716 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX11P35716 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX11P35716 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX11P35716 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX11P35716 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX11P35716 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX11P35716 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX11P35716 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX11P35716 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX11P35716 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX11P35716 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX11P35716 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX11P35716 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX11P35716 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX11P35716 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX11P35716 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX11P35716 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX11P35716 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SOX11P35716 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX11P35716 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX11P35716 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX11P35716 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX11P35716 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX11P35716 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX11P35716 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX11P35716 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX11P35716 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX11P35716 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX11P35716 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX11P35716 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX11P35716 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX11P35716 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX11P35716 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX11P35716 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX11P35716 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX11P35716 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX11P35716 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX11P35716 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX11P35716 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX11P35716 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX11P35716 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX11P35716 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX11P35716 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX11P35716 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX11P35716 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX11P35716 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX11P35716 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms