Protein–RNA interactions for Protein: P33121

ACSL1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL1P33121 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSL1P33121 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSL1P33121 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSL1P33121 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSL1P33121 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSL1P33121 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSL1P33121 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSL1P33121 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSL1P33121 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSL1P33121 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSL1P33121 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSL1P33121 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSL1P33121 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSL1P33121 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSL1P33121 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSL1P33121 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSL1P33121 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACSL1P33121 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACSL1P33121 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACSL1P33121 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACSL1P33121 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ACSL1P33121 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACSL1P33121 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACSL1P33121 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ACSL1P33121 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSL1P33121 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSL1P33121 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSL1P33121 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSL1P33121 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSL1P33121 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSL1P33121 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSL1P33121 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSL1P33121 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSL1P33121 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSL1P33121 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSL1P33121 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSL1P33121 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSL1P33121 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSL1P33121 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSL1P33121 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSL1P33121 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSL1P33121 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSL1P33121 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSL1P33121 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSL1P33121 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSL1P33121 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSL1P33121 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms