Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DSG3P32926 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DSG3P32926 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DSG3P32926 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DSG3P32926 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DSG3P32926 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
DSG3P32926 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DSG3P32926 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DSG3P32926 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DSG3P32926 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DSG3P32926 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DSG3P32926 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DSG3P32926 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DSG3P32926 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DSG3P32926 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DSG3P32926 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
DSG3P32926 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DSG3P32926 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DSG3P32926 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DSG3P32926 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DSG3P32926 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DSG3P32926 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DSG3P32926 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
DSG3P32926 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DSG3P32926 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
DSG3P32926 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DSG3P32926 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DSG3P32926 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
DSG3P32926 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
DSG3P32926 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DSG3P32926 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DSG3P32926 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DSG3P32926 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DSG3P32926 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DSG3P32926 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DSG3P32926 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DSG3P32926 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DSG3P32926 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DSG3P32926 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
DSG3P32926 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DSG3P32926 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DSG3P32926 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DSG3P32926 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DSG3P32926 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DSG3P32926 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DSG3P32926 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DSG3P32926 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DSG3P32926 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DSG3P32926 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DSG3P32926 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DSG3P32926 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DSG3P32926 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DSG3P32926 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DSG3P32926 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DSG3P32926 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DSG3P32926 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DSG3P32926 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DSG3P32926 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DSG3P32926 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DSG3P32926 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DSG3P32926 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DSG3P32926 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DSG3P32926 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DSG3P32926 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DSG3P32926 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DSG3P32926 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DSG3P32926 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DSG3P32926 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DSG3P32926 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DSG3P32926 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DSG3P32926 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DSG3P32926 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DSG3P32926 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
DSG3P32926 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
DSG3P32926 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DSG3P32926 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DSG3P32926 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DSG3P32926 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DSG3P32926 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DSG3P32926 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DSG3P32926 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DSG3P32926 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
DSG3P32926 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
DSG3P32926 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DSG3P32926 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
DSG3P32926 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DSG3P32926 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DSG3P32926 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DSG3P32926 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DSG3P32926 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DSG3P32926 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DSG3P32926 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DSG3P32926 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DSG3P32926 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DSG3P32926 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DSG3P32926 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DSG3P32926 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DSG3P32926 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DSG3P32926 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DSG3P32926 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms