Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF2H1P32780 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2H1P32780 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTF2H1P32780 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms