Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABRA5P31644 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRA5P31644 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABRA5P31644 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABRA5P31644 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABRA5P31644 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABRA5P31644 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRA5P31644 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRA5P31644 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRA5P31644 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRA5P31644 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRA5P31644 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRA5P31644 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRA5P31644 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRA5P31644 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRA5P31644 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRA5P31644 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms