Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSPOP30536 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TSPOP30536 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSPOP30536 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSPOP30536 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSPOP30536 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSPOP30536 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSPOP30536 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSPOP30536 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSPOP30536 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSPOP30536 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSPOP30536 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSPOP30536 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSPOP30536 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSPOP30536 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSPOP30536 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TSPOP30536 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSPOP30536 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSPOP30536 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSPOP30536 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSPOP30536 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSPOP30536 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TSPOP30536 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSPOP30536 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSPOP30536 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSPOP30536 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSPOP30536 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSPOP30536 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSPOP30536 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSPOP30536 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSPOP30536 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSPOP30536 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSPOP30536 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSPOP30536 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSPOP30536 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSPOP30536 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSPOP30536 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSPOP30536 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TSPOP30536 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TSPOP30536 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSPOP30536 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSPOP30536 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSPOP30536 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TSPOP30536 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSPOP30536 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSPOP30536 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSPOP30536 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSPOP30536 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSPOP30536 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSPOP30536 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSPOP30536 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TSPOP30536 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSPOP30536 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TSPOP30536 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TSPOP30536 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TSPOP30536 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSPOP30536 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSPOP30536 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TSPOP30536 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TSPOP30536 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TSPOP30536 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSPOP30536 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSPOP30536 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSPOP30536 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSPOP30536 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSPOP30536 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSPOP30536 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSPOP30536 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSPOP30536 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSPOP30536 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSPOP30536 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSPOP30536 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSPOP30536 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSPOP30536 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSPOP30536 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSPOP30536 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSPOP30536 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TSPOP30536 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSPOP30536 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSPOP30536 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSPOP30536 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TSPOP30536 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSPOP30536 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSPOP30536 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSPOP30536 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TSPOP30536 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSPOP30536 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSPOP30536 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSPOP30536 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSPOP30536 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSPOP30536 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSPOP30536 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSPOP30536 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TSPOP30536 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TSPOP30536 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSPOP30536 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TSPOP30536 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSPOP30536 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSPOP30536 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSPOP30536 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms