Protein–RNA interactions for Protein: P28331

NDUFS1, NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS1P28331 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFS1P28331 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFS1P28331 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFS1P28331 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFS1P28331 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFS1P28331 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFS1P28331 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms