Protein–RNA interactions for Protein: P27694

RPA1, Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA1P27694 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPA1P27694 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPA1P27694 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPA1P27694 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPA1P27694 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPA1P27694 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RPA1P27694 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPA1P27694 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPA1P27694 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPA1P27694 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPA1P27694 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPA1P27694 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPA1P27694 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPA1P27694 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPA1P27694 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPA1P27694 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPA1P27694 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPA1P27694 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPA1P27694 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPA1P27694 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPA1P27694 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPA1P27694 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPA1P27694 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPA1P27694 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPA1P27694 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPA1P27694 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPA1P27694 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RPA1P27694 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPA1P27694 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPA1P27694 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPA1P27694 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPA1P27694 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPA1P27694 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPA1P27694 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPA1P27694 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPA1P27694 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RPA1P27694 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPA1P27694 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPA1P27694 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPA1P27694 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPA1P27694 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPA1P27694 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPA1P27694 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RPA1P27694 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPA1P27694 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPA1P27694 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPA1P27694 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPA1P27694 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPA1P27694 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPA1P27694 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPA1P27694 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPA1P27694 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPA1P27694 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPA1P27694 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPA1P27694 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPA1P27694 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RPA1P27694 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPA1P27694 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPA1P27694 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RPA1P27694 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPA1P27694 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPA1P27694 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPA1P27694 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPA1P27694 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPA1P27694 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPA1P27694 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPA1P27694 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RPA1P27694 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPA1P27694 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPA1P27694 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPA1P27694 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPA1P27694 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPA1P27694 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPA1P27694 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPA1P27694 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPA1P27694 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPA1P27694 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPA1P27694 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPA1P27694 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPA1P27694 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPA1P27694 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPA1P27694 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPA1P27694 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPA1P27694 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPA1P27694 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPA1P27694 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPA1P27694 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPA1P27694 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPA1P27694 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPA1P27694 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RPA1P27694 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RPA1P27694 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPA1P27694 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPA1P27694 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPA1P27694 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPA1P27694 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPA1P27694 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPA1P27694 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPA1P27694 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPA1P27694 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms