Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MARK3P27448 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MARK3P27448 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MARK3P27448 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MARK3P27448 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MARK3P27448 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MARK3P27448 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MARK3P27448 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MARK3P27448 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MARK3P27448 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MARK3P27448 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MARK3P27448 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MARK3P27448 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MARK3P27448 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MARK3P27448 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MARK3P27448 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MARK3P27448 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MARK3P27448 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MARK3P27448 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MARK3P27448 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MARK3P27448 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MARK3P27448 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MARK3P27448 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MARK3P27448 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARK3P27448 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARK3P27448 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARK3P27448 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARK3P27448 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARK3P27448 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARK3P27448 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MARK3P27448 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARK3P27448 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARK3P27448 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARK3P27448 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARK3P27448 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARK3P27448 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARK3P27448 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARK3P27448 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARK3P27448 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARK3P27448 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARK3P27448 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MARK3P27448 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MARK3P27448 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MARK3P27448 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MARK3P27448 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MARK3P27448 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MARK3P27448 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MARK3P27448 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MARK3P27448 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MARK3P27448 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MARK3P27448 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MARK3P27448 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MARK3P27448 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MARK3P27448 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MARK3P27448 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MARK3P27448 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MARK3P27448 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MARK3P27448 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MARK3P27448 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MARK3P27448 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MARK3P27448 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MARK3P27448 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MARK3P27448 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MARK3P27448 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MARK3P27448 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MARK3P27448 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MARK3P27448 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MARK3P27448 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MARK3P27448 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MARK3P27448 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MARK3P27448 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARK3P27448 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARK3P27448 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARK3P27448 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARK3P27448 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARK3P27448 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARK3P27448 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARK3P27448 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARK3P27448 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARK3P27448 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARK3P27448 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARK3P27448 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARK3P27448 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARK3P27448 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARK3P27448 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MARK3P27448 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARK3P27448 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARK3P27448 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARK3P27448 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MARK3P27448 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARK3P27448 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARK3P27448 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARK3P27448 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARK3P27448 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARK3P27448 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARK3P27448 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARK3P27448 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARK3P27448 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARK3P27448 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARK3P27448 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms