Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSMA4P25789 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMA4P25789 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA4P25789 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms