Protein–RNA interactions for Protein: P25364

HCM1, Forkhead transcription factor HCM1, yeastyeast

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCM1P25364 YCL065WYCL065W 369 nt5.7□□□□□ -1.5
HCM1P25364 YDR154CYDR154C 351 nt5.7□□□□□ -1.5
HCM1P25364 YDR278CYDR278C 318 nt5.7□□□□□ -1.5
HCM1P25364 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt5.7□□□□□ -1.5
HCM1P25364 PEF1YGR058W 1008 nt5.7□□□□□ -1.5
HCM1P25364 YGR176WYGR176W 348 nt5.7□□□□□ -1.5
HCM1P25364 RSM26YJR101W 801 nt5.7□□□□□ -1.5
HCM1P25364 RRP36YOR287C 903 nt5.7□□□□□ -1.5
HCM1P25364 PAP1YKR002W 1707 nt5.7□□□□□ -1.5
HCM1P25364 YFL042CYFL042C 2025 nt5.7□□□□□ -1.5
HCM1P25364 BZZ1YHR114W 1902 nt5.7□□□□□ -1.5
HCM1P25364 XBP1YIL101C 1944 nt5.7□□□□□ -1.5
HCM1P25364 MRC1YCL061C 3291 nt5.7□□□□□ -1.5
HCM1P25364 PAD1YDR538W 729 nt5.69□□□□□ -1.5
HCM1P25364 RRP4YHR069C 1080 nt5.69□□□□□ -1.5
HCM1P25364 CTR2YHR175W 570 nt5.69□□□□□ -1.5
HCM1P25364 QCR8YJL166W 285 nt5.69□□□□□ -1.5
HCM1P25364 GAT3YLR013W 426 nt5.69□□□□□ -1.5
HCM1P25364 PML1YLR016C 615 nt5.69□□□□□ -1.5
HCM1P25364 HST2YPL015C 1074 nt5.69□□□□□ -1.5
HCM1P25364 CKS1YBR135W 453 nt5.69□□□□□ -1.5
HCM1P25364 YCK1YHR135C 1617 nt5.69□□□□□ -1.5
HCM1P25364 DRS1YLL008W 2259 nt5.69□□□□□ -1.5
HCM1P25364 MPA43YNL249C 1629 nt5.69□□□□□ -1.5
HCM1P25364 NDC1YML031W 1968 nt5.69□□□□□ -1.5
HCM1P25364 YHL017WYHL017W 1599 nt5.68□□□□□ -1.5
HCM1P25364 YAP1801YHR161C 1914 nt5.68□□□□□ -1.5
HCM1P25364 YPK3YBR028C 1578 nt5.68□□□□□ -1.5
HCM1P25364 MTQ2YDR140W 666 nt5.68□□□□□ -1.5
HCM1P25364 STE2YFL026W 1296 nt5.68□□□□□ -1.5
HCM1P25364 IMP3YHR148W 552 nt5.68□□□□□ -1.5
HCM1P25364 MND2YIR025W 1107 nt5.68□□□□□ -1.5
HCM1P25364 CPR6YLR216C 1116 nt5.68□□□□□ -1.5
HCM1P25364 YML083CYML083C 1257 nt5.68□□□□□ -1.5
HCM1P25364 BSC4YNL269W 396 nt5.68□□□□□ -1.5
HCM1P25364 YPL014WYPL014W 1146 nt5.68□□□□□ -1.5
HCM1P25364 PEX32YBR168W 1242 nt5.68□□□□□ -1.5
HCM1P25364 RMD1YDL001W 1293 nt5.67□□□□□ -1.5
HCM1P25364 YRA1YDR381W 681 nt5.67□□□□□ -1.5
HCM1P25364 PRO3YER023W 861 nt5.67□□□□□ -1.5
HCM1P25364 CIR1YGR207C 786 nt5.67□□□□□ -1.5
HCM1P25364 BCY1YIL033C 1251 nt5.67□□□□□ -1.5
HCM1P25364 HSP150YJL159W 1242 nt5.67□□□□□ -1.5
HCM1P25364 LAC1YKL008C 1257 nt5.67□□□□□ -1.5
HCM1P25364 ATP14YLR295C 375 nt5.67□□□□□ -1.5
HCM1P25364 YMR245WYMR245W 621 nt5.67□□□□□ -1.5
HCM1P25364 RAS1YOR101W 930 nt5.67□□□□□ -1.5
HCM1P25364 RPS9AYPL081W 594 nt5.67□□□□□ -1.5
HCM1P25364 ATG18YFR021W 1503 nt5.67□□□□□ -1.5
HCM1P25364 VHS1YDR247W 1386 nt5.67□□□□□ -1.5
HCM1P25364 IES1YFL013C 2079 nt5.67□□□□□ -1.5
HCM1P25364 PAT1YCR077C 2391 nt5.66□□□□□ -1.5
HCM1P25364 YLR345WYLR345W 1530 nt5.66□□□□□ -1.5
HCM1P25364 YDR042CYDR042C 603 nt5.66□□□□□ -1.5
HCM1P25364 CBS2YDR197W 1170 nt5.66□□□□□ -1.5
HCM1P25364 TRS23YDR246W 660 nt5.66□□□□□ -1.5
HCM1P25364 NCS6YGL211W 1080 nt5.66□□□□□ -1.5
HCM1P25364 POP6YGR030C 477 nt5.66□□□□□ -1.5
HCM1P25364 SPO11YHL022C 1197 nt5.66□□□□□ -1.5
HCM1P25364 CCE1YKL011C 1062 nt5.66□□□□□ -1.5
HCM1P25364 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt5.66□□□□□ -1.5
HCM1P25364 YBL036CYBL036C 774 nt5.66□□□□□ -1.5
HCM1P25364 MDM12YOL009C 816 nt5.66□□□□□ -1.5
HCM1P25364 CKB2YOR039W 777 nt5.66□□□□□ -1.5
HCM1P25364 RFM1YOR279C 933 nt5.66□□□□□ -1.5
HCM1P25364 GRX5YPL059W 453 nt5.66□□□□□ -1.5
HCM1P25364 YPL191CYPL191C 1083 nt5.66□□□□□ -1.5
HCM1P25364 MED8YBR193C 672 nt5.66□□□□□ -1.5
HCM1P25364 SUB2YDL084W 1341 nt5.66□□□□□ -1.5
HCM1P25364 YJR124CYJR124C 1347 nt5.66□□□□□ -1.5
HCM1P25364 LSG1YGL099W 1923 nt5.66□□□□□ -1.5
HCM1P25364 SLI1YGR212W 1407 nt5.65□□□□□ -1.5
HCM1P25364 CLB2YPR119W 1476 nt5.65□□□□□ -1.5
HCM1P25364 SHM1YBR263W 1473 nt5.65□□□□□ -1.5
HCM1P25364 PTR2YKR093W 1806 nt5.65□□□□□ -1.5
HCM1P25364 HEM3YDL205C 984 nt5.65□□□□□ -1.5
HCM1P25364 SLO1YER180C-A 258 nt5.65□□□□□ -1.5
HCM1P25364 IRC6YFR043C 714 nt5.65□□□□□ -1.5
HCM1P25364 YGL214WYGL214W 486 nt5.65□□□□□ -1.5
HCM1P25364 ALB1YJL122W 528 nt5.65□□□□□ -1.5
HCM1P25364 RPB4YJL140W 666 nt5.65□□□□□ -1.5
HCM1P25364 YJL171CYJL171C 1191 nt5.65□□□□□ -1.5
HCM1P25364 ATG16YMR159C 453 nt5.65□□□□□ -1.5
HCM1P25364 YBL062WYBL062W 381 nt5.65□□□□□ -1.5
HCM1P25364 YOL035CYOL035C 303 nt5.65□□□□□ -1.5
HCM1P25364 REX4YOL080C 870 nt5.65□□□□□ -1.5
HCM1P25364 IPP1YBR011C 864 nt5.65□□□□□ -1.5
HCM1P25364 MED4YOR174W 855 nt5.65□□□□□ -1.5
HCM1P25364 UBA3YPR066W 900 nt5.65□□□□□ -1.5
HCM1P25364 MSS116YDR194C 1995 nt5.65□□□□□ -1.51
HCM1P25364 LDB17YDL146W 1476 nt5.64□□□□□ -1.51
HCM1P25364 YDR249CYDR249C 1122 nt5.64□□□□□ -1.51
HCM1P25364 IPK1YDR315C 846 nt5.64□□□□□ -1.51
HCM1P25364 MRPL49YJL096W 486 nt5.64□□□□□ -1.51
HCM1P25364 TOM40YMR203W 1164 nt5.64□□□□□ -1.51
HCM1P25364 RXT2YBR095C 1293 nt5.64□□□□□ -1.51
HCM1P25364 RRT2YBR246W 1164 nt5.64□□□□□ -1.51
HCM1P25364 APA1YCL050C 966 nt5.64□□□□□ -1.51
HCM1P25364 RTT106YNL206C 1368 nt5.64□□□□□ -1.51
HCM1P25364 ATG4YNL223W 1485 nt5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.7 ms