Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPREP23469 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPREP23469 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPREP23469 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPREP23469 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPREP23469 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPREP23469 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPREP23469 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPREP23469 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPREP23469 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPREP23469 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPREP23469 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPREP23469 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPREP23469 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPREP23469 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPREP23469 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPREP23469 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPREP23469 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPREP23469 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPREP23469 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPREP23469 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPREP23469 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPREP23469 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPREP23469 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPREP23469 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPREP23469 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPREP23469 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPREP23469 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPREP23469 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPREP23469 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPREP23469 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPREP23469 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPREP23469 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPREP23469 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPREP23469 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPREP23469 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPREP23469 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPREP23469 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPREP23469 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPREP23469 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPREP23469 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPREP23469 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPREP23469 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPREP23469 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPREP23469 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPREP23469 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPREP23469 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPREP23469 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPREP23469 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPREP23469 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPREP23469 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPREP23469 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPREP23469 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPREP23469 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPREP23469 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPREP23469 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPREP23469 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPREP23469 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPREP23469 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPREP23469 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPREP23469 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPREP23469 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPREP23469 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPREP23469 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPREP23469 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPREP23469 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPREP23469 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPREP23469 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPREP23469 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPREP23469 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPREP23469 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPREP23469 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPREP23469 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPREP23469 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPREP23469 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPREP23469 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPREP23469 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPREP23469 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPREP23469 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPREP23469 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPREP23469 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPREP23469 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPREP23469 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPREP23469 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPREP23469 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPREP23469 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPREP23469 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPREP23469 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPREP23469 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPREP23469 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPREP23469 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPREP23469 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPREP23469 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPREP23469 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPREP23469 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPREP23469 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPREP23469 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPREP23469 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPREP23469 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPREP23469 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
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