Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 SLC4A7-204ENST00000428005 1572 ntTSL 1 (best)22.55■■□□□ 1.29e-10■■■■■ 35.5
RPS3P23396 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.499e-10■■■■■ 35.5
RPS3P23396 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.469e-10■■■■■ 35.5
RPS3P23396 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.457e-7■■■■■ 35.5
RPS3P23396 FH-202ENST00000493477 414 ntTSL 317.68■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 35.5
RPS3P23396 BAG3-202ENST00000450186 1146 ntTSL 516.21■□□□□ 0.197e-7■■■■■ 35.5
RPS3P23396 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.169e-10■■■■■ 35.5
RPS3P23396 SLC4A7-208ENST00000437266 3407 ntTSL 1 (best)14.9□□□□□ -0.029e-10■■■■■ 35.5
RPS3P23396 CCDC12-211ENST00000604367 2412 nt14.88□□□□□ -0.039e-10■■■■■ 35.5
RPS3P23396 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.079e-10■■■■■ 35.5
RPS3P23396 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.19e-10■■■■■ 35.5
RPS3P23396 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.159e-10■■■■■ 35.5
RPS3P23396 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.189e-10■■■■■ 35.5
RPS3P23396 SLC4A7-209ENST00000438530 3825 ntTSL 1 (best)13.87□□□□□ -0.199e-10■■■■■ 35.5
RPS3P23396 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.219e-10■■■■■ 35.5
RPS3P23396 SLC4A7-215ENST00000457377 3600 ntTSL 1 (best)13.72□□□□□ -0.219e-10■■■■■ 35.5
RPS3P23396 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.249e-10■■■■■ 35.5
RPS3P23396 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.269e-10■■■■■ 35.5
RPS3P23396 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.399e-10■■■■■ 35.5
RPS3P23396 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.399e-10■■■■■ 35.5
RPS3P23396 ACLY-205ENST00000588547 471 ntTSL 39.24□□□□□ -0.939e-10■■■■■ 35.5
RPS3P23396 CAB39-207ENST00000614925 1619 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -19e-10■■■■■ 35.5
RPS3P23396 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.163e-7■■■■■ 35.5
RPS3P23396 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.293e-7■■■■■ 35.5
RPS3P23396 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.023e-7■■■■■ 35.5
RPS3P23396 TCP1-215ENST00000544255 1403 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.333e-7■■■■■ 35.5
RPS3P23396 NDUFA2-203ENST00000510680 576 ntTSL 212.75□□□□□ -0.372e-10■■■■■ 35.4
RPS3P23396 ALDH18A1-204ENST00000485428 726 ntTSL 28.86□□□□□ -0.991e-7■■■■■ 35.4
RPS3P23396 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.321e-10■■■■■ 35.4
RPS3P23396 ELOB-203ENST00000409906 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.751e-10■■■■■ 35.4
RPS3P23396 ELOB-201ENST00000262306 582 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.781e-10■■■■■ 35.4
RPS3P23396 ELOB-204ENST00000494946 472 ntTSL 29.05□□□□□ -0.961e-10■■■■■ 35.4
RPS3P23396 ELOB-205ENST00000572954 331 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.991e-10■■■■■ 35.4
RPS3P23396 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.049e-8■■■■■ 35.4
RPS3P23396 FAM96B-202ENST00000562362 713 ntTSL 321.17■□□□□ 0.982e-8■■■■■ 35.4
RPS3P23396 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.281e-7■■■■■ 35.4
RPS3P23396 FAM96B-203ENST00000563490 718 ntTSL 214.34□□□□□ -0.112e-8■■■■■ 35.4
RPS3P23396 FAM96B-204ENST00000567511 696 ntTSL 513.52□□□□□ -0.252e-8■■■■■ 35.4
RPS3P23396 FAM96B-201ENST00000422424 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.22e-8■■■■■ 35.4
RPS3P23396 TXNRD1-216ENST00000527335 786 ntTSL 510.94□□□□□ -0.661e-6■■■■■ 35.4
RPS3P23396 PRMT5-209ENST00000553502 414 ntTSL 314.04□□□□□ -0.161e-6■■■■■ 35.4
RPS3P23396 PRMT5-221ENST00000556043 603 ntTSL 33.13□□□□□ -1.911e-6■■■■■ 35.4
RPS3P23396 FAM98A-206ENST00000475122 1032 ntTSL 1 (best)21.36■■□□□ 1.011e-9■■■■■ 35.4
RPS3P23396 RPUSD3-205ENST00000427174 907 ntTSL 521.1■□□□□ 0.977e-7■■■■■ 35.4
RPS3P23396 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.947e-7■■■■■ 35.4
RPS3P23396 RPUSD3-202ENST00000418713 955 ntTSL 219.43■□□□□ 0.77e-7■■■■■ 35.4
RPS3P23396 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.667e-7■■■■■ 35.4
RPS3P23396 RPUSD3-216ENST00000484134 2491 ntTSL 219.08■□□□□ 0.647e-7■■■■■ 35.4
RPS3P23396 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.571e-9■■■■■ 35.4
RPS3P23396 JPT2-213ENST00000569256 911 ntTSL 1 (best)17.45■□□□□ 0.387e-7■■■■■ 35.4
RPS3P23396 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.327e-7■■■■■ 35.4
RPS3P23396 JPT2-209ENST00000566742 593 ntTSL 415.79■□□□□ 0.127e-7■■■■■ 35.4
RPS3P23396 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.057e-7■■■■■ 35.4
RPS3P23396 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.095e-14■■■■■ 35.4
RPS3P23396 FAM98A-205ENST00000474985 3546 ntTSL 214.46□□□□□ -0.11e-9■■■■■ 35.4
RPS3P23396 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.187e-7■■■■■ 35.4
RPS3P23396 ASF1A-202ENST00000511766 573 ntTSL 213.53□□□□□ -0.245e-14■■■■■ 35.4
RPS3P23396 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.251e-9■■■■■ 35.4
RPS3P23396 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.421e-9■■■■■ 35.4
RPS3P23396 FAM98A-202ENST00000403368 2818 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.441e-9■■■■■ 35.4
RPS3P23396 EDARADD-204ENST00000637660 2803 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.451e-9■■■■■ 35.4
RPS3P23396 JPT2-206ENST00000562684 3185 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.457e-7■■■■■ 35.4
RPS3P23396 JPT2-201ENST00000248098 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.57e-7■■■■■ 35.4
RPS3P23396 JPT2-202ENST00000382710 962 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.597e-7■■■■■ 35.4
RPS3P23396 JPT2-207ENST00000565851 565 ntTSL 1 (best)11.25□□□□□ -0.617e-7■■■■■ 35.4
RPS3P23396 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.617e-7■■■■■ 35.4
RPS3P23396 JPT2-208ENST00000566691 601 ntTSL 59.73□□□□□ -0.857e-7■■■■■ 35.4
RPS3P23396 ENO1P1-201ENST00000366587 1304 ntBASIC9.73□□□□□ -0.851e-9■■■■■ 35.4
RPS3P23396 JPT2-210ENST00000566925 570 ntTSL 48.56□□□□□ -1.047e-7■■■■■ 35.4
RPS3P23396 JPT2-205ENST00000562569 458 ntTSL 36.17□□□□□ -1.427e-7■■■■■ 35.4
RPS3P23396 PSMB7-206ENST00000498485 967 ntTSL 513.52□□□□□ -0.252e-7■■■■■ 35.4
RPS3P23396 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.174e-7■■■■■ 35.4
RPS3P23396 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.294e-7■■■■■ 35.4
RPS3P23396 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.334e-7■■■■■ 35.4
RPS3P23396 DHX30-207ENST00000457607 3748 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.414e-7■■■■■ 35.4
RPS3P23396 DHX30-206ENST00000446256 3660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.454e-7■■■■■ 35.4
RPS3P23396 DHX30-202ENST00000395745 3887 ntTSL 1 (best)10.95□□□□□ -0.664e-7■■■■■ 35.4
RPS3P23396 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.062e-6■■■■■ 35.4
RPS3P23396 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 35.4
RPS3P23396 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 35.4
RPS3P23396 MIF-203ENST00000498385 435 ntTSL 219.76■□□□□ 0.756e-46■■■■■ 35.3
RPS3P23396 GSTO1-203ENST00000432659 592 ntTSL 22.74□□□□□ -1.971e-9■■■■■ 35.3
RPS3P23396 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.897e-13■■■■■ 35.3
RPS3P23396 HADHB-205ENST00000448743 557 ntTSL 55.45□□□□□ -1.541e-9■■■■■ 35.2
RPS3P23396 APOH-203ENST00000581797 748 ntTSL 36.21□□□□□ -1.429e-53■■■■■ 35.2
RPS3P23396 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.247e-8■■■■■ 35.2
RPS3P23396 SPP1-205ENST00000505146 252 ntTSL 31.37□□□□□ -2.192e-17■■■■■ 35.2
RPS3P23396 MCM2-207ENST00000477668 2510 ntTSL 218.97■□□□□ 0.631e-6■■■■■ 35.2
RPS3P23396 PSMA2-205ENST00000457444 801 ntTSL 38.18□□□□□ -1.13e-7■■■■■ 35.1
RPS3P23396 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 35.1
RPS3P23396 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 35.1
RPS3P23396 LDHA-209ENST00000478970 732 ntTSL 215.43■□□□□ 0.064e-13■■■■■ 35.1
RPS3P23396 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.382e-41■■■■■ 35.1
RPS3P23396 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.222e-41■■■■■ 35.1
RPS3P23396 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.432e-41■■■■■ 35.1
RPS3P23396 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.134e-7■■■■■ 35.1
RPS3P23396 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.215e-7■■■■■ 35
RPS3P23396 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.843e-8■■■■■ 35
RPS3P23396 PCOLCE-210ENST00000496269 995 ntTSL 221.48■■□□□ 1.038e-7■■■■■ 35
RPS3P23396 IMPDH2-206ENST00000466147 691 ntTSL 217.15■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 35
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