Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
HRCP23327 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
HRCP23327 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
HRCP23327 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
HRCP23327 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
HRCP23327 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
HRCP23327 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
HRCP23327 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
HRCP23327 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
HRCP23327 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
HRCP23327 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
HRCP23327 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
HRCP23327 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
HRCP23327 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
HRCP23327 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
HRCP23327 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
HRCP23327 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
HRCP23327 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
HRCP23327 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
HRCP23327 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
HRCP23327 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
HRCP23327 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
HRCP23327 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
HRCP23327 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
HRCP23327 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
HRCP23327 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
HRCP23327 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
HRCP23327 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
HRCP23327 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
HRCP23327 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
HRCP23327 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
HRCP23327 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
HRCP23327 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
HRCP23327 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
HRCP23327 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
HRCP23327 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
HRCP23327 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
HRCP23327 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
HRCP23327 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
HRCP23327 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
HRCP23327 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
HRCP23327 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
HRCP23327 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
HRCP23327 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
HRCP23327 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
HRCP23327 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
HRCP23327 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
HRCP23327 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
HRCP23327 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
HRCP23327 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
HRCP23327 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
HRCP23327 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
HRCP23327 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
HRCP23327 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
HRCP23327 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
HRCP23327 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
HRCP23327 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
HRCP23327 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
HRCP23327 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
HRCP23327 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
HRCP23327 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
HRCP23327 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
HRCP23327 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
HRCP23327 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
HRCP23327 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
HRCP23327 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
HRCP23327 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
HRCP23327 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
HRCP23327 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
HRCP23327 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
HRCP23327 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
HRCP23327 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
HRCP23327 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
HRCP23327 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
HRCP23327 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
HRCP23327 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
HRCP23327 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
HRCP23327 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
HRCP23327 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
HRCP23327 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
HRCP23327 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
HRCP23327 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
HRCP23327 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
HRCP23327 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
HRCP23327 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
HRCP23327 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
HRCP23327 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
HRCP23327 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
HRCP23327 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
HRCP23327 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
HRCP23327 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
HRCP23327 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
HRCP23327 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
HRCP23327 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
HRCP23327 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
HRCP23327 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
HRCP23327 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
HRCP23327 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
HRCP23327 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
HRCP23327 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms