Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGFR4P22455 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGFR4P22455 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGFR4P22455 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms