Protein–RNA interactions for Protein: P21695

GPD1, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)], cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD1P21695 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPD1P21695 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPD1P21695 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPD1P21695 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPD1P21695 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPD1P21695 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPD1P21695 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPD1P21695 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPD1P21695 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPD1P21695 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPD1P21695 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPD1P21695 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPD1P21695 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPD1P21695 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPD1P21695 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPD1P21695 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPD1P21695 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPD1P21695 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPD1P21695 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPD1P21695 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPD1P21695 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPD1P21695 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPD1P21695 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPD1P21695 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPD1P21695 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPD1P21695 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPD1P21695 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPD1P21695 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPD1P21695 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPD1P21695 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPD1P21695 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPD1P21695 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPD1P21695 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPD1P21695 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPD1P21695 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPD1P21695 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPD1P21695 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPD1P21695 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPD1P21695 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPD1P21695 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPD1P21695 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPD1P21695 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GPD1P21695 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPD1P21695 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPD1P21695 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPD1P21695 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPD1P21695 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPD1P21695 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPD1P21695 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPD1P21695 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPD1P21695 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPD1P21695 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPD1P21695 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPD1P21695 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPD1P21695 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GPD1P21695 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GPD1P21695 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPD1P21695 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GPD1P21695 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GPD1P21695 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPD1P21695 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPD1P21695 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPD1P21695 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPD1P21695 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPD1P21695 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPD1P21695 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPD1P21695 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPD1P21695 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPD1P21695 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPD1P21695 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPD1P21695 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPD1P21695 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPD1P21695 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPD1P21695 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPD1P21695 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPD1P21695 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPD1P21695 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPD1P21695 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPD1P21695 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPD1P21695 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPD1P21695 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPD1P21695 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPD1P21695 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPD1P21695 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPD1P21695 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPD1P21695 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GPD1P21695 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPD1P21695 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPD1P21695 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPD1P21695 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPD1P21695 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPD1P21695 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPD1P21695 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPD1P21695 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPD1P21695 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GPD1P21695 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GPD1P21695 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPD1P21695 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPD1P21695 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPD1P21695 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms