Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTNP21246 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTNP21246 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTNP21246 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTNP21246 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTNP21246 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTNP21246 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTNP21246 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTNP21246 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTNP21246 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PTNP21246 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTNP21246 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTNP21246 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTNP21246 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTNP21246 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTNP21246 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTNP21246 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTNP21246 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PTNP21246 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTNP21246 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTNP21246 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PTNP21246 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTNP21246 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTNP21246 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTNP21246 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTNP21246 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTNP21246 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTNP21246 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTNP21246 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTNP21246 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PTNP21246 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTNP21246 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTNP21246 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTNP21246 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTNP21246 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTNP21246 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTNP21246 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTNP21246 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTNP21246 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTNP21246 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTNP21246 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTNP21246 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTNP21246 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTNP21246 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTNP21246 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTNP21246 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTNP21246 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTNP21246 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTNP21246 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTNP21246 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTNP21246 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTNP21246 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTNP21246 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTNP21246 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTNP21246 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTNP21246 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTNP21246 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTNP21246 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTNP21246 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTNP21246 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTNP21246 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTNP21246 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTNP21246 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTNP21246 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTNP21246 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTNP21246 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTNP21246 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTNP21246 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTNP21246 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTNP21246 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTNP21246 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTNP21246 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTNP21246 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTNP21246 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTNP21246 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTNP21246 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTNP21246 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTNP21246 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTNP21246 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTNP21246 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PTNP21246 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTNP21246 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PTNP21246 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTNP21246 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTNP21246 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTNP21246 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTNP21246 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTNP21246 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTNP21246 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTNP21246 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTNP21246 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PTNP21246 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTNP21246 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTNP21246 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTNP21246 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTNP21246 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTNP21246 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTNP21246 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTNP21246 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTNP21246 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms