Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK11BP21127 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CDK11BP21127 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK11BP21127 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms