Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CASTP20810 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CASTP20810 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CASTP20810 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CASTP20810 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CASTP20810 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CASTP20810 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CASTP20810 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CASTP20810 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CASTP20810 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CASTP20810 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CASTP20810 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CASTP20810 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CASTP20810 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CASTP20810 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASTP20810 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASTP20810 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASTP20810 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASTP20810 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASTP20810 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASTP20810 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASTP20810 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASTP20810 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CASTP20810 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CASTP20810 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CASTP20810 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CASTP20810 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CASTP20810 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CASTP20810 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CASTP20810 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CASTP20810 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CASTP20810 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CASTP20810 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CASTP20810 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CASTP20810 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CASTP20810 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CASTP20810 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CASTP20810 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASTP20810 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASTP20810 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASTP20810 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CASTP20810 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASTP20810 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASTP20810 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASTP20810 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASTP20810 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASTP20810 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CASTP20810 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASTP20810 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASTP20810 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASTP20810 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASTP20810 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASTP20810 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASTP20810 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASTP20810 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASTP20810 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CASTP20810 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CASTP20810 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CASTP20810 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CASTP20810 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CASTP20810 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CASTP20810 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASTP20810 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASTP20810 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASTP20810 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASTP20810 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASTP20810 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CASTP20810 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CASTP20810 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CASTP20810 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CASTP20810 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CASTP20810 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CASTP20810 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CASTP20810 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CASTP20810 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASTP20810 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CASTP20810 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASTP20810 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASTP20810 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASTP20810 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASTP20810 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASTP20810 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASTP20810 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASTP20810 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASTP20810 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASTP20810 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASTP20810 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASTP20810 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASTP20810 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASTP20810 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASTP20810 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASTP20810 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASTP20810 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASTP20810 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASTP20810 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CASTP20810 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASTP20810 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASTP20810 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASTP20810 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASTP20810 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms