Protein–RNA interactions for Protein: P20309

CHRM3, Muscarinic acetylcholine receptor M3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM3P20309 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRM3P20309 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRM3P20309 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRM3P20309 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms