Protein–RNA interactions for Protein: P20061

TCN1, Transcobalamin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN1P20061 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCN1P20061 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCN1P20061 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCN1P20061 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCN1P20061 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCN1P20061 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCN1P20061 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCN1P20061 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCN1P20061 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCN1P20061 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCN1P20061 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCN1P20061 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCN1P20061 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCN1P20061 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCN1P20061 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TCN1P20061 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TCN1P20061 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCN1P20061 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCN1P20061 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCN1P20061 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCN1P20061 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCN1P20061 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCN1P20061 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCN1P20061 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCN1P20061 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCN1P20061 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCN1P20061 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCN1P20061 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCN1P20061 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCN1P20061 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCN1P20061 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCN1P20061 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCN1P20061 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TCN1P20061 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCN1P20061 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TCN1P20061 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCN1P20061 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCN1P20061 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCN1P20061 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCN1P20061 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCN1P20061 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCN1P20061 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCN1P20061 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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TCN1P20061 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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TCN1P20061 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCN1P20061 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCN1P20061 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCN1P20061 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCN1P20061 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCN1P20061 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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TCN1P20061 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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TCN1P20061 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCN1P20061 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCN1P20061 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCN1P20061 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TCN1P20061 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCN1P20061 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCN1P20061 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TCN1P20061 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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TCN1P20061 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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TCN1P20061 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCN1P20061 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCN1P20061 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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TCN1P20061 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCN1P20061 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCN1P20061 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCN1P20061 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCN1P20061 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCN1P20061 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCN1P20061 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCN1P20061 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCN1P20061 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCN1P20061 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCN1P20061 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCN1P20061 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCN1P20061 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCN1P20061 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TCN1P20061 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TCN1P20061 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCN1P20061 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCN1P20061 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCN1P20061 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCN1P20061 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCN1P20061 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCN1P20061 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCN1P20061 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCN1P20061 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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