Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERCC3P19447 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC3P19447 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC3P19447 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms