Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPI1P17947 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPI1P17947 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPI1P17947 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPI1P17947 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPI1P17947 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPI1P17947 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPI1P17947 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPI1P17947 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPI1P17947 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPI1P17947 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPI1P17947 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPI1P17947 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPI1P17947 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPI1P17947 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPI1P17947 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPI1P17947 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPI1P17947 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPI1P17947 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPI1P17947 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPI1P17947 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPI1P17947 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPI1P17947 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPI1P17947 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SPI1P17947 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SPI1P17947 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPI1P17947 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPI1P17947 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPI1P17947 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPI1P17947 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SPI1P17947 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPI1P17947 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPI1P17947 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPI1P17947 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPI1P17947 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPI1P17947 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPI1P17947 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPI1P17947 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SPI1P17947 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPI1P17947 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPI1P17947 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPI1P17947 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPI1P17947 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPI1P17947 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPI1P17947 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SPI1P17947 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPI1P17947 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPI1P17947 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPI1P17947 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPI1P17947 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPI1P17947 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPI1P17947 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPI1P17947 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPI1P17947 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPI1P17947 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPI1P17947 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPI1P17947 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPI1P17947 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPI1P17947 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPI1P17947 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPI1P17947 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPI1P17947 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPI1P17947 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SPI1P17947 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPI1P17947 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPI1P17947 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPI1P17947 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPI1P17947 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPI1P17947 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPI1P17947 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPI1P17947 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPI1P17947 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPI1P17947 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPI1P17947 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPI1P17947 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPI1P17947 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPI1P17947 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPI1P17947 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPI1P17947 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPI1P17947 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPI1P17947 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPI1P17947 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPI1P17947 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPI1P17947 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPI1P17947 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPI1P17947 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SPI1P17947 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPI1P17947 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPI1P17947 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPI1P17947 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPI1P17947 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPI1P17947 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPI1P17947 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPI1P17947 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPI1P17947 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPI1P17947 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SPI1P17947 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPI1P17947 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPI1P17947 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPI1P17947 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms