Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GM2AP17900 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GM2AP17900 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GM2AP17900 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GM2AP17900 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GM2AP17900 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GM2AP17900 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GM2AP17900 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GM2AP17900 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GM2AP17900 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GM2AP17900 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GM2AP17900 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GM2AP17900 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GM2AP17900 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GM2AP17900 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GM2AP17900 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GM2AP17900 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GM2AP17900 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GM2AP17900 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GM2AP17900 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GM2AP17900 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GM2AP17900 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GM2AP17900 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GM2AP17900 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GM2AP17900 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GM2AP17900 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GM2AP17900 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GM2AP17900 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GM2AP17900 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GM2AP17900 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GM2AP17900 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GM2AP17900 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GM2AP17900 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GM2AP17900 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GM2AP17900 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GM2AP17900 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GM2AP17900 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GM2AP17900 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GM2AP17900 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GM2AP17900 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GM2AP17900 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GM2AP17900 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GM2AP17900 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GM2AP17900 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GM2AP17900 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GM2AP17900 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GM2AP17900 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GM2AP17900 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GM2AP17900 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GM2AP17900 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GM2AP17900 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GM2AP17900 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GM2AP17900 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GM2AP17900 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GM2AP17900 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GM2AP17900 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GM2AP17900 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GM2AP17900 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GM2AP17900 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GM2AP17900 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GM2AP17900 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GM2AP17900 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GM2AP17900 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GM2AP17900 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GM2AP17900 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GM2AP17900 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GM2AP17900 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GM2AP17900 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GM2AP17900 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GM2AP17900 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GM2AP17900 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GM2AP17900 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GM2AP17900 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GM2AP17900 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GM2AP17900 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GM2AP17900 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GM2AP17900 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GM2AP17900 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GM2AP17900 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GM2AP17900 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GM2AP17900 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GM2AP17900 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GM2AP17900 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GM2AP17900 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GM2AP17900 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GM2AP17900 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GM2AP17900 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GM2AP17900 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GM2AP17900 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GM2AP17900 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GM2AP17900 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GM2AP17900 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GM2AP17900 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GM2AP17900 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GM2AP17900 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GM2AP17900 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GM2AP17900 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GM2AP17900 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GM2AP17900 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GM2AP17900 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms