Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTPS1P17812 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTPS1P17812 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms