Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA2P17301 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA2P17301 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA2P17301 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA2P17301 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA2P17301 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA2P17301 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA2P17301 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA2P17301 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA2P17301 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA2P17301 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA2P17301 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA2P17301 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA2P17301 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA2P17301 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA2P17301 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA2P17301 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA2P17301 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA2P17301 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA2P17301 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA2P17301 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITGA2P17301 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA2P17301 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA2P17301 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA2P17301 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA2P17301 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA2P17301 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA2P17301 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA2P17301 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA2P17301 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA2P17301 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITGA2P17301 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA2P17301 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA2P17301 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA2P17301 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA2P17301 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA2P17301 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA2P17301 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA2P17301 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA2P17301 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA2P17301 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA2P17301 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA2P17301 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA2P17301 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA2P17301 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA2P17301 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA2P17301 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA2P17301 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA2P17301 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA2P17301 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA2P17301 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA2P17301 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA2P17301 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA2P17301 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA2P17301 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA2P17301 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA2P17301 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA2P17301 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA2P17301 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA2P17301 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA2P17301 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA2P17301 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA2P17301 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA2P17301 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA2P17301 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA2P17301 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA2P17301 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA2P17301 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA2P17301 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA2P17301 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA2P17301 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA2P17301 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA2P17301 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA2P17301 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA2P17301 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA2P17301 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA2P17301 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA2P17301 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA2P17301 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA2P17301 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA2P17301 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA2P17301 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA2P17301 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA2P17301 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA2P17301 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA2P17301 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA2P17301 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA2P17301 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA2P17301 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA2P17301 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA2P17301 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA2P17301 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA2P17301 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA2P17301 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA2P17301 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA2P17301 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA2P17301 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA2P17301 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA2P17301 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA2P17301 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms