Protein–RNA interactions for Protein: P17038

ZNF43, Zinc finger protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF43P17038 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF43P17038 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF43P17038 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.6 ms