Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB3P14651 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOXB3P14651 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB3P14651 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms