Protein–RNA interactions for Protein: P14543

NID1, Nidogen-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID1P14543 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NID1P14543 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NID1P14543 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NID1P14543 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NID1P14543 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NID1P14543 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NID1P14543 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NID1P14543 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NID1P14543 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NID1P14543 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NID1P14543 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NID1P14543 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NID1P14543 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NID1P14543 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NID1P14543 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NID1P14543 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NID1P14543 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NID1P14543 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NID1P14543 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NID1P14543 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NID1P14543 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NID1P14543 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NID1P14543 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NID1P14543 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NID1P14543 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NID1P14543 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NID1P14543 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NID1P14543 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NID1P14543 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NID1P14543 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NID1P14543 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NID1P14543 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NID1P14543 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NID1P14543 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NID1P14543 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NID1P14543 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NID1P14543 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NID1P14543 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NID1P14543 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NID1P14543 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NID1P14543 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NID1P14543 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NID1P14543 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NID1P14543 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NID1P14543 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NID1P14543 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NID1P14543 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NID1P14543 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NID1P14543 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NID1P14543 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NID1P14543 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NID1P14543 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NID1P14543 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NID1P14543 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NID1P14543 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NID1P14543 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NID1P14543 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NID1P14543 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NID1P14543 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NID1P14543 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NID1P14543 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NID1P14543 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NID1P14543 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NID1P14543 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NID1P14543 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NID1P14543 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NID1P14543 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NID1P14543 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NID1P14543 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NID1P14543 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NID1P14543 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NID1P14543 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NID1P14543 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NID1P14543 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NID1P14543 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NID1P14543 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NID1P14543 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NID1P14543 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NID1P14543 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NID1P14543 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NID1P14543 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NID1P14543 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NID1P14543 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NID1P14543 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NID1P14543 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NID1P14543 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NID1P14543 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NID1P14543 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NID1P14543 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NID1P14543 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NID1P14543 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NID1P14543 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NID1P14543 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NID1P14543 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NID1P14543 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NID1P14543 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NID1P14543 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NID1P14543 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NID1P14543 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NID1P14543 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms