Protein–RNA interactions for Protein: P14317

HCLS1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1P14317 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HCLS1P14317 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HCLS1P14317 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HCLS1P14317 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HCLS1P14317 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HCLS1P14317 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HCLS1P14317 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HCLS1P14317 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HCLS1P14317 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HCLS1P14317 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HCLS1P14317 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HCLS1P14317 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HCLS1P14317 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
HCLS1P14317 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HCLS1P14317 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HCLS1P14317 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HCLS1P14317 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HCLS1P14317 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HCLS1P14317 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HCLS1P14317 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HCLS1P14317 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HCLS1P14317 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HCLS1P14317 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HCLS1P14317 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HCLS1P14317 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HCLS1P14317 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HCLS1P14317 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HCLS1P14317 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HCLS1P14317 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HCLS1P14317 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HCLS1P14317 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HCLS1P14317 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HCLS1P14317 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
HCLS1P14317 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HCLS1P14317 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HCLS1P14317 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HCLS1P14317 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
HCLS1P14317 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HCLS1P14317 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HCLS1P14317 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HCLS1P14317 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HCLS1P14317 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
HCLS1P14317 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HCLS1P14317 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HCLS1P14317 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HCLS1P14317 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HCLS1P14317 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HCLS1P14317 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HCLS1P14317 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HCLS1P14317 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HCLS1P14317 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HCLS1P14317 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HCLS1P14317 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HCLS1P14317 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HCLS1P14317 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HCLS1P14317 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HCLS1P14317 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HCLS1P14317 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms