Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
CFTRP13569 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
CFTRP13569 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
CFTRP13569 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
CFTRP13569 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
CFTRP13569 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CFTRP13569 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
CFTRP13569 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CFTRP13569 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CFTRP13569 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
CFTRP13569 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
CFTRP13569 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
CFTRP13569 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
CFTRP13569 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
CFTRP13569 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
CFTRP13569 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
CFTRP13569 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
CFTRP13569 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.03
CFTRP13569 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.03
CFTRP13569 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC40.19■■■■■ 4.03
CFTRP13569 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC40.19■■■■■ 4.03
CFTRP13569 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC40.19■■■■■ 4.03
CFTRP13569 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC40.19■■■■■ 4.03
CFTRP13569 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC40.19■■■■■ 4.03
CFTRP13569 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC40.19■■■■■ 4.03
CFTRP13569 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC40.19■■■■■ 4.03
CFTRP13569 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC40.19■■■■■ 4.03
CFTRP13569 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC40.19■■■■■ 4.03
CFTRP13569 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
CFTRP13569 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
CFTRP13569 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
CFTRP13569 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
CFTRP13569 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.17■■■■■ 4.02
CFTRP13569 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC40.17■■■■■ 4.02
CFTRP13569 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
CFTRP13569 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CFTRP13569 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CFTRP13569 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
CFTRP13569 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
CFTRP13569 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
CFTRP13569 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
CFTRP13569 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC40.15■■■■■ 4.02
CFTRP13569 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
CFTRP13569 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CFTRP13569 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
CFTRP13569 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
CFTRP13569 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
CFTRP13569 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CFTRP13569 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
CFTRP13569 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.13■■■■■ 4.02
CFTRP13569 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC40.13■■■■■ 4.02
CFTRP13569 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC40.13■■■■■ 4.02
CFTRP13569 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
CFTRP13569 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
CFTRP13569 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
CFTRP13569 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC40.13■■■■■ 4.01
CFTRP13569 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
CFTRP13569 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
CFTRP13569 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
CFTRP13569 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
CFTRP13569 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
CFTRP13569 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
CFTRP13569 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
CFTRP13569 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
CFTRP13569 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
CFTRP13569 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
CFTRP13569 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
CFTRP13569 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CFTRP13569 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
CFTRP13569 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CFTRP13569 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
CFTRP13569 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
CFTRP13569 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
CFTRP13569 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
CFTRP13569 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
CFTRP13569 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
CFTRP13569 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
CFTRP13569 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
CFTRP13569 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
CFTRP13569 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
CFTRP13569 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
CFTRP13569 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
CFTRP13569 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
CFTRP13569 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
CFTRP13569 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4.01
CFTRP13569 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
CFTRP13569 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
CFTRP13569 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
CFTRP13569 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4.01
CFTRP13569 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
CFTRP13569 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4
CFTRP13569 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
CFTRP13569 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
CFTRP13569 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
CFTRP13569 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
CFTRP13569 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC40.06■■■■■ 4
CFTRP13569 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
CFTRP13569 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
CFTRP13569 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
CFTRP13569 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC40.05■■■■■ 4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms