Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ESRRAP11474 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ESRRAP11474 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms