Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
TOP2AP11388 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
TOP2AP11388 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
TOP2AP11388 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
TOP2AP11388 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
TOP2AP11388 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
TOP2AP11388 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
TOP2AP11388 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
TOP2AP11388 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
TOP2AP11388 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
TOP2AP11388 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
TOP2AP11388 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
TOP2AP11388 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
TOP2AP11388 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC40.96■■■■■ 4.15
TOP2AP11388 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
TOP2AP11388 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC40.96■■■■■ 4.15
TOP2AP11388 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
TOP2AP11388 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
TOP2AP11388 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
TOP2AP11388 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
TOP2AP11388 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
TOP2AP11388 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
TOP2AP11388 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
TOP2AP11388 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
TOP2AP11388 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
TOP2AP11388 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.15
TOP2AP11388 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
TOP2AP11388 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
TOP2AP11388 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
TOP2AP11388 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
TOP2AP11388 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
TOP2AP11388 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
TOP2AP11388 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
TOP2AP11388 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
TOP2AP11388 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
TOP2AP11388 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
TOP2AP11388 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
TOP2AP11388 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
TOP2AP11388 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
TOP2AP11388 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
TOP2AP11388 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
TOP2AP11388 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
TOP2AP11388 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
TOP2AP11388 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
TOP2AP11388 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
TOP2AP11388 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
TOP2AP11388 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
TOP2AP11388 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
TOP2AP11388 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
TOP2AP11388 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
TOP2AP11388 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
TOP2AP11388 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC40.88■■■■■ 4.14
TOP2AP11388 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.14
TOP2AP11388 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
TOP2AP11388 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
TOP2AP11388 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
TOP2AP11388 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
TOP2AP11388 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
TOP2AP11388 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
TOP2AP11388 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
TOP2AP11388 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
TOP2AP11388 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
TOP2AP11388 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
TOP2AP11388 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
TOP2AP11388 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
TOP2AP11388 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
TOP2AP11388 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
TOP2AP11388 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
TOP2AP11388 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
TOP2AP11388 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
TOP2AP11388 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
TOP2AP11388 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
TOP2AP11388 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
TOP2AP11388 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
TOP2AP11388 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
TOP2AP11388 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
TOP2AP11388 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
TOP2AP11388 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
TOP2AP11388 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
TOP2AP11388 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
TOP2AP11388 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
TOP2AP11388 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC40.83■■■■■ 4.13
TOP2AP11388 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
TOP2AP11388 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
TOP2AP11388 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.13
TOP2AP11388 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
TOP2AP11388 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
TOP2AP11388 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
TOP2AP11388 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
TOP2AP11388 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
TOP2AP11388 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
TOP2AP11388 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
TOP2AP11388 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
TOP2AP11388 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
TOP2AP11388 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
TOP2AP11388 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
TOP2AP11388 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC40.79■■■■■ 4.12
TOP2AP11388 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC40.79■■■■■ 4.12
TOP2AP11388 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
TOP2AP11388 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms