Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRM1P11229 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRM1P11229 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRM1P11229 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRM1P11229 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRM1P11229 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRM1P11229 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRM1P11229 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRM1P11229 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHRM1P11229 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHRM1P11229 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHRM1P11229 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRM1P11229 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRM1P11229 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRM1P11229 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRM1P11229 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRM1P11229 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRM1P11229 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRM1P11229 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRM1P11229 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRM1P11229 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRM1P11229 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRM1P11229 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRM1P11229 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRM1P11229 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRM1P11229 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRM1P11229 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRM1P11229 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRM1P11229 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRM1P11229 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRM1P11229 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRM1P11229 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRM1P11229 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRM1P11229 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRM1P11229 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRM1P11229 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRM1P11229 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRM1P11229 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRM1P11229 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRM1P11229 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms