Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NR2F1P10589 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR2F1P10589 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms