Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC192P0DO97 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC192P0DO97 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms