Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM13P0DJ93 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM13P0DJ93 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms