Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM6P0DI80 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM6P0DI80 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM6P0DI80 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM6P0DI80 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM6P0DI80 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM6P0DI80 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM6P0DI80 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM6P0DI80 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM6P0DI80 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM6P0DI80 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM6P0DI80 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM6P0DI80 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM6P0DI80 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM6P0DI80 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMIM6P0DI80 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMIM6P0DI80 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMIM6P0DI80 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM6P0DI80 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMIM6P0DI80 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMIM6P0DI80 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMIM6P0DI80 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms