Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC166P0CW27 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC166P0CW27 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC166P0CW27 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.5 ms